实验室非常重视公用平台的建设与发展，近几年来围绕学科前沿和国家战略需求，重点建设了五个中心平台（海洋微型生物保种、海洋数据、海上调查、海洋仪器研发和质谱中心）和十四个功能实验室（生态毒理、分子生物、同位素示踪技术、海洋微型生物生态、色谱、光谱、营养盐、碳分析、海洋光生物、海洋浮游植物、海洋生物影像、氮循环、海洋基因组、环境基因组和生物信息学）组成的功能实验室群，全面向科研人员提供开放服务。   碳分析功能实验室 Carbon Analysis Lab 海洋微型生物生态功能实验室 Marine Microbial Ecology Lab 营养盐分析功能实验室 Nutrient Analysis Lab 色谱分析功能实验室 Chromatography Lab 海洋光生物学功能实验室 Marine Photobiology Lab 生态毒理学功能实验室 Ecotoxicology Lab 分子生物学功能实验室 Molecular Biology Lab 海洋浮游植物功能实验室 Marine Phytoplankton Lab 海洋生物影像功能实验室 Marine Biological Imaging Lab 同位素示踪技术功能实验室 Radiochemistry Lab 氮循环功能实验室 Nitrogen Biogeochemistry Lab 海洋基因组学功能实验室 Marine Genomics Lab 环境基因组和生物信息学功能实验室Environmental Genomics and Bioinformatics Lab