实验室非常重视公用平台的建设与发展，近几年来围绕学科前沿和国家战略需求，重点建设了五个中心平台（海洋痕量元素分析中心、海洋观测技术与数据中心、海洋仪器研发中心、质谱中心、海洋微型生物保种中心）和十三个功能实验室（碳分析、海洋微型生物生态、营养盐、色谱、海洋光生物、生态毒理、分子生物、海洋浮游植物、海洋生物影像、同位素示踪技术、氮循环、海洋基因组、环境基因组和生物信息学）组成的功能实验室群，全面向科研人员提供开放服务。   海洋痕量元素分析中心 Center for Oceanic Trace Element Analysis 海洋观测技术与数据中心 Ocean Observation Technology and Data Center 海洋仪器研发中心 Ocean Intrumentation Development and Application Center 质谱中心 Mass Spectrometry Center 海洋微型生物保种中心 Center for Collections of Marine Bacteria and Algae